Дезинфекция водопроводных сооружений является обязательным санитарным мероприятием. Она должна производиться как в плановом профилактическом порядке (примерно один раз в три года). Обеззараживание участка водопровода осуществляется путём заполнения его водой с рассчитанной дозой гипохлорита натрия на промежуток времени, необходимый для уничтожения вредных микроорганизмов: бактерий, вирусов и т.п. После определенной выдержки и промывки трубопровода производятся лабораторные анализы с целью определения эффективности дезинфекции отремонтированного участка.